Alphys es una monstruo con apariencia semejante a la de un reptil.

Es la Científica Real, alcanzó tal puesto al crear un robot con alma dentro. El primer encuentro con ella sucede en el Laboratorio ubicado en Hotland, el cual también es su hogar.

Alphys es una "nerd", tímida y algo solitaria que adora el anime y los cómics de manga. A menudo tartamudea y parece haber desarrollado una gran admiración por el humano después de haberle visto a través de las cámaras que tiene alrededor de todo el Underground. Tiene sentimientos románticos porUndyne, aunque cree que no son correspondidos, resultan ser ciertos como se muestra Verdadera Ruta Pacifista.

Si se responde "Asgore" en el concurso de preguntas de Mettaton cuando este pregunta de quién está enamorada Alphys, ella demuestra una reacción similar a si respondes "Undyne", demostrando que también mantuvo cierta atracción por él en el pasado.

Posee un lado oculto de sí misma lleno de culpa, temor e inseguridades de sus logros y si sobre si misma. Como las existencias de Flowey y de los Amalgamas. Este lado de ella es revelado en el Laboratorio Verdadero.